Metaheurísticas para descubrimiento de fármacos
Implementación de metaheurísticas aplicadas al diseño de fármacos para blancos moléculares específicos.
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Universidad Nacional de Cuyo
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Universidad Gastón Dachary
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Universidad Gastón Dachary
Matías Gabriel Rojas
Becario Doctoral CONICET • Ingeniero en Informática
Ciudad de Mendoza, Argentina
Sobre mí
Ingeniero en informática. 31 Años. Becario doctoral del Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET). Parte del Grupo de Ciencias de la Computación y los Datos en el Instituto Interdisciplinario de Ciencias Básicas (ICB). Mi trabajo se centra en el diseño e implementación de algoritmos de inteligencia computacional aplicados a problemas de bioinformática.
Temas de interés
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Análisis de expresión diferencial en cáncer
Descubrimiento de biomarcadores y análisis de expresión diferencial en cáncer.
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Producción de Muestras genéticas artificiales
Uso de técnicas generativas para la producción de muestras de expresión génica artificiales.
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Métodos alternativos de entrenamiento de redes neuronales para casos médicos
Metaheurísticas aplicadas a la configuración de pesos y sesgos de redes neuronales para soporte al diagnóstico médico.
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Alineamiento múltiple de secuencias
Diseño de metaheurísticas para el alineamiento múltiple de secuencias de ADN, ARN y Proteínas.
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Ensamblado de fragmentos de ADN y diseño de estructuras ARN
Aplicación de metaheurísticas multi y mono objetivo para el ensamblado de fragmentos de ADN y diseño de moléculas ARN que se adecúen a estructuras de plegado específicas.
Educación
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Publicaciones científicas
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2025
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Memetic genetic particle swarm optimization for druglike molecule discovery
IEEE Latin America Transactions • DOI: 10.1109/TLA.2025.10879174
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A new micro-genetic crossover operator for effective training of medical neural networks
Springer Nature Computer Sciences • DOI: 10.1007/s42979-025-04077-z
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Massive Production of Cancer Synthetic RNA-Seq Gene Expression Samples
Springer Nature Computer Sciences • DOI: 10.1007/s42979-025-04251-3
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Hibridación memética para el diseño de fármacos de-novo: una extensión al diseño de fármacos antidiabéticos
XXXII Jornadas de Jovenes Investigadores de la Asociación de Universidades Grupo Montevideo
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Desarrollo de metaheurísticas aplicadas a genómica estructural y funcional
Tercer Simposio Iberoamericano de Maestría y Doctorado en Inteligencia Artificial (SIMDIA’2025)
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Desarrollo de técnicas de inteligencia computacional y artificial aplicadas a problemas de genómica estructural y funcional
XXVII Workshop de Investigadores en Ciencias de la Computación, WICC 2025
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Diseño e implementación de metaheurísticas meméticas para la selección de genes relevantes en muestras de cáncer
Primeras Jornadas de Doctorado de la FCEN-UNCUYO
2024
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A genetic operators-based ant lion optimiser for training a medical multi-layer perceptron
Applied Soft Computing • DOI: 10.1016/j.asoc.2023.111192
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2023
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A Memetic micro-genetic algorithms for cancer data classification
Intelligent Systems with Applications • DOI: 10.1016/j.iswa.2022.200173
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2022
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Optimising multilayer perceptron weights and biases through a cellular genetic algorithm for medical data classification
Array • DOI: 10.1016/j.array.2022.100173
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Desarrollo de técnicas de inteligencia computacional para el análisis de datos genómicos
XXIV Workshop de Investigadores en Ciencias de la Computación, WICC 2022
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A modified multi-swarm optimization for weights and biases of a multi-layer perceptron for medical data classification
2022 IEEE Biennial Congress of Argentina, ARGENCON 2022 • DOI: 10.1109/ARGENCON55245.2022.9940066
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2020
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A memetic cellular genetic algorithm for cancer data microarray feature selection
IEEE Latin America Transactions • DOI: 10.1109/TLA.2020.9398628
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Hybrid cuckoo search for solving dna fragment assembly problem
4to Congreso Internacional de Ciencias de la Computación y Sistemas de Información
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Optimización de support vector machine mediante metaheurísticas para clasificación de retinopatía diabética
Jornadas Argentinas de Informática e Investigación Operativa, JAIIO 2020
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A memetic cellular genetic algorithm for multiple sequence alignment
2020 IEEE Biennial Congress of Argentina, ARGENCON 2020 • DOI: 10.1109/ARGENCON49523.2020.9505544
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Docencia
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Auxiliar Adscripto Ad-honorem
Universidad Nacional de Cuyo
Asignatura: Compiladores (4to año)
Licenciatura en Ciencias de la Computación • Facultad de Ingeniería
Computación | Área: 22 - Teoría de la Computación
Experiencia laboral
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IJS Ingeniería Eléctrica
Desarrollador PHP/Laravel Freelance
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Administración de Consorcio Ricardo Moya
Desarrollador Java
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That Metal Shop
Desarrollador WordPress/WooCommerce
Becas obtenidas
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Beca Interna Doctoral
CONICET
Proyecto: Diseño y desarrollo de técnicas metaheurísticas aplicadas a problemas de bioinformática
Directora: Dra. Jessica Andrea Carballido | Co-Directora: Dra. Ana Carolina Olivera
Instituto Interdisciplinario de Ciencias Básicas (ICB), Mendoza
Beca de Curso de Posgrado 🇮🇹 Internacional
Università degli Studi di Padova / Ministerio de Educación AR
Proyecto: Métodos Avanzados de Bioinformática
La beca incluyó cobertura total de viáticos, traslados y gastos de alimentación.
Padua, Italia
Beca de Investigación, Innovación y Desarrollo Tecnológico
CEDIT
Proyecto: Prototipo de sistema de clasificación de documentos web basado en relevancia semántica
Director: Ing. Fabián Edgardo Favrét
CITIC, Universidad Gastón Dachary, Misiones
Proyectos de investigación
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Métodos inteligentes utilizados en el procesamiento de imágenes y su aplicación en la resolución de problemas socio-productivos
Universidad Nacional de Cuyo - SIIP Res. 1651/2025
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Pablo Javier Vidal
ID: 80020240100021UN • Financiamiento: $ 300.000 ARS
Desarrollo de Algoritmos, modelado predictivo y análisis bioinformático basado en el desarrollo de técnicas de aprendizaje automático
Universidad Nacional del Sur - SGCyT Res. CSU-378/2025
Director/a: Dra. Jessica Andrea Carballido | Co-Director/a: Dra. Rocio L. Cecchini
ID: 24/N061 • Financiamiento: $ 1.450.964 ARS
Desarrollo de métodos inteligentes para la detección temprana de enfermedades utilizando imágenes digitales en problemas transferibles al sector socio-productivo
CONICET RD - EX-2022-90513226-APN-DCP#CONICET
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Emmanuel Nicolás Millán
ID: PIP 2023-2025 • Financiamiento: $ 2.950.000 ARS
Modelado predictivo en bioinformática basado en el desarrollo de técnicas de computación evolutiva y aprendizaje automático
Universidad Nacional del Sur - SGCyT Res. CSU-362/2020
Director/a: Dra. Jessica Andrea Carballido
ID: 24/N052 • Financiamiento: $ 109.993 ARS
Inteligencia computacional aplicada a problemas de optimización
Universidad Nacional de Cuyo - SIIP Res. 3978/2022
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Pablo Javier Vidal
ID: 06/B052-T1 • Financiamiento: $ 80.000 ARS
Diseño y desarrollo de herramientas metaheurísticas y aplicaciones novedosas orientadas a smart mobility
Universidad Nacional de Cuyo - SIIP Res. 4142/2019
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Pablo Javier Vidal
ID: 06/B081-B • Financiamiento: $ 22.500 ARS
Habilidades técnicas
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IA y Optimización
- Metaheurísticas
- Aprendizaje Automático (Machine Learning)
- Aprendizaje Profundo
Bioinformática
- Diseño de Fármacos
- Genómica Funcional
- Genómica Estructural
Desarrollo y Herramientas
- Python
- C++
- R
- LaTeX
- Git
- Astro
- Linux
Idiomas
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Inglés
Advanced (C1)Instituto Green Hill (en colaboración con EF)
Capacidad para comprender textos complejos y con fines académicos o de investigación.
Español
NativoLengua materna.