Metaheurísticas para descubrimiento de fármacos
Implementación de metaheurísticas aplicadas al diseño de fármacos para blancos moléculares específicos.
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Universidad Nacional de Cuyo
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Universidad Gastón Dachary
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Universidad Gastón Dachary
Matías Gabriel Rojas
Becario Doctoral CONICET • Doctor en Ciencia y Tecnología
Ciudad de Mendoza, Argentina
Sobre mí
Doctor en Ciencia y Tecnología e Ingeniero en Informática. 31 años. Becario doctoral del Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET) e integrante del Grupo de Ciencias de la Computación y los Datos del Instituto Interdisciplinario de Ciencias Básicas (ICB). Mi investigación se enfoca en el desarrollo de métodos de inteligencia computacional para la resolución de problemas de bioinformática, con énfasis en aprendizaje automático, optimización y diseño asistido de fármacos.
Temas de interés
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Análisis de expresión diferencial en cáncer
Descubrimiento de biomarcadores y análisis de expresión diferencial en cáncer.
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Producción de Muestras genéticas artificiales
Uso de técnicas generativas para la producción de muestras de expresión génica artificiales.
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Métodos alternativos de entrenamiento de redes neuronales para casos médicos
Metaheurísticas aplicadas a la configuración de pesos y sesgos de redes neuronales para soporte al diagnóstico médico.
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Alineamiento múltiple de secuencias
Diseño de metaheurísticas para el alineamiento múltiple de secuencias de ADN, ARN y Proteínas.
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Ensamblado de fragmentos de ADN y diseño de estructuras ARN
Aplicación de metaheurísticas multi y mono objetivo para el ensamblado de fragmentos de ADN y diseño de moléculas ARN que se adecúen a estructuras de plegado específicas.
Educación
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Publicaciones científicas
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2025
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Memetic genetic particle swarm optimization for druglike molecule discovery
IEEE Latin America Transactions • DOI: 10.1109/TLA.2025.10879174
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A new micro-genetic crossover operator for effective training of medical neural networks
Springer Nature Computer Sciences • DOI: 10.1007/s42979-025-04077-z
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Massive Production of Cancer Synthetic RNA-Seq Gene Expression Samples
Springer Nature Computer Sciences • DOI: 10.1007/s42979-025-04251-3
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Hibridación memética para el diseño de fármacos de-novo: una extensión al diseño de fármacos antidiabéticos
XXXII Jornadas de Jovenes Investigadores de la Asociación de Universidades Grupo Montevideo
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Desarrollo de metaheurísticas aplicadas a genómica estructural y funcional
Tercer Simposio Iberoamericano de Maestría y Doctorado en Inteligencia Artificial (SIMDIA’2025)
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Desarrollo de técnicas de inteligencia computacional y artificial aplicadas a problemas de genómica estructural y funcional
XXVII Workshop de Investigadores en Ciencias de la Computación, WICC 2025
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Diseño e implementación de metaheurísticas meméticas para la selección de genes relevantes en muestras de cáncer
Primeras Jornadas de Doctorado de la FCEN-UNCUYO
2024
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A genetic operators-based ant lion optimiser for training a medical multi-layer perceptron
Applied Soft Computing • DOI: 10.1016/j.asoc.2023.111192
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2023
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A Memetic micro-genetic algorithms for cancer data classification
Intelligent Systems with Applications • DOI: 10.1016/j.iswa.2022.200173
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2022
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Optimising multilayer perceptron weights and biases through a cellular genetic algorithm for medical data classification
Array • DOI: 10.1016/j.array.2022.100173
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Desarrollo de técnicas de inteligencia computacional para el análisis de datos genómicos
XXIV Workshop de Investigadores en Ciencias de la Computación, WICC 2022
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A modified multi-swarm optimization for weights and biases of a multi-layer perceptron for medical data classification
2022 IEEE Biennial Congress of Argentina, ARGENCON 2022 • DOI: 10.1109/ARGENCON55245.2022.9940066
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2020
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A memetic cellular genetic algorithm for cancer data microarray feature selection
IEEE Latin America Transactions • DOI: 10.1109/TLA.2020.9398628
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Hybrid cuckoo search for solving dna fragment assembly problem
4to Congreso Internacional de Ciencias de la Computación y Sistemas de Información
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Optimización de support vector machine mediante metaheurísticas para clasificación de retinopatía diabética
Jornadas Argentinas de Informática e Investigación Operativa, JAIIO 2020
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A memetic cellular genetic algorithm for multiple sequence alignment
2020 IEEE Biennial Congress of Argentina, ARGENCON 2020 • DOI: 10.1109/ARGENCON49523.2020.9505544
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Docencia
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Jefe de Trabajos Prácticos, dedicación simple, interino
Universidad Nacional de Cuyo
Asignatura: Compiladores (5to año)
Licenciatura en Ciencias de la Computación • Facultad de Ingeniería
Computación | Área: 22 - Teoría de la Computación
Auxiliar Adscripto Ad-honorem
Universidad Nacional de Cuyo
Asignatura: Compiladores (4to año)
Licenciatura en Ciencias de la Computación • Facultad de Ingeniería
Computación | Área: 22 - Teoría de la Computación
Experiencia laboral
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IJS Ingeniería Eléctrica
Desarrollador PHP/Laravel Freelance
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Administración de Consorcio Ricardo Moya
Desarrollador Java
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That Metal Shop
Desarrollador WordPress/WooCommerce
Becas obtenidas
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Beca Interna Doctoral
CONICET
Proyecto: Diseño y desarrollo de técnicas metaheurísticas aplicadas a problemas de bioinformática
Directora: Dra. Jessica Andrea Carballido | Co-Directora: Dra. Ana Carolina Olivera
Instituto Interdisciplinario de Ciencias Básicas (ICB), Mendoza
Beca de Curso de Posgrado 🇮🇹 Internacional
Università degli Studi di Padova / Ministerio de Educación AR
Proyecto: Métodos Avanzados de Bioinformática
La beca incluyó cobertura total de viáticos, traslados y gastos de alimentación.
Padua, Italia
Beca de Investigación, Innovación y Desarrollo Tecnológico
CEDIT
Proyecto: Prototipo de sistema de clasificación de documentos web basado en relevancia semántica
Director: Ing. Fabián Edgardo Favrét
CITIC, Universidad Gastón Dachary, Misiones
Proyectos de investigación
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Hibridación de modelos de difusión y metaheurísticas multiobjetivo para la generación de fármacos en contextos de datos limitados
Universidad Nacional de Cuyo - Facultad de Ingeniería Res. 373/2026
Director/a: Ing. Matías Gabriel Rojas | Co-Director/a: Dr. Pablo Javier Vidal
ID: Res. FI Nro. 373/2026 • Financiamiento: $ 300,000 ARS
Métodos inteligentes utilizados en el procesamiento de imágenes y su aplicación en la resolución de problemas socio-productivos
Universidad Nacional de Cuyo - SIIP Res. 1651/2025
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Pablo Javier Vidal
ID: 80020240100021UN • Financiamiento: $ 300.000 ARS
Desarrollo de Algoritmos, modelado predictivo y análisis bioinformático basado en el desarrollo de técnicas de aprendizaje automático
Universidad Nacional del Sur - SGCyT Res. CSU-378/2025
Director/a: Dra. Jessica Andrea Carballido | Co-Director/a: Dra. Rocio L. Cecchini
ID: 24/N061 • Financiamiento: $ 1.450.964 ARS
Desarrollo de métodos inteligentes para la detección temprana de enfermedades utilizando imágenes digitales en problemas transferibles al sector socio-productivo
CONICET RD - EX-2022-90513226-APN-DCP#CONICET
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Emmanuel Nicolás Millán
ID: PIP 2023-2025 • Financiamiento: $ 2.950.000 ARS
Modelado predictivo en bioinformática basado en el desarrollo de técnicas de computación evolutiva y aprendizaje automático
Universidad Nacional del Sur - SGCyT Res. CSU-362/2020
Director/a: Dra. Jessica Andrea Carballido
ID: 24/N052 • Financiamiento: $ 109.993 ARS
Inteligencia computacional aplicada a problemas de optimización
Universidad Nacional de Cuyo - SIIP Res. 3978/2022
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Pablo Javier Vidal
ID: 06/B052-T1 • Financiamiento: $ 80.000 ARS
Diseño y desarrollo de herramientas metaheurísticas y aplicaciones novedosas orientadas a smart mobility
Universidad Nacional de Cuyo - SIIP Res. 4142/2019
Director/a: Dra. Ana Carolina Olivera | Co-Director/a: Dr. Pablo Javier Vidal
ID: 06/B081-B • Financiamiento: $ 22.500 ARS
Habilidades técnicas
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IA y Optimización
- Metaheurísticas
- Aprendizaje Automático (Machine Learning)
- Aprendizaje Profundo
Bioinformática
- Diseño de Fármacos
- Genómica Funcional
- Genómica Estructural
Desarrollo y Herramientas
- Python
- C++
- R
- LaTeX
- Git
- Astro
- Linux
Idiomas
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Inglés
Advanced (C1)Instituto Green Hill (en colaboración con EF)
Capacidad para comprender textos complejos y con fines académicos o de investigación.
Español
NativoLengua materna.